La trombina es específica para proteínas que tengan la secuencia PRG
Es regioselectiva porque cataliza la hidrólisis del enlace entre RCO-NG respetando los enlaces adyacentes
Es enantioselectiva porque requiere que el sitio presente L-α-aminoácidos
Es selectiva de configuración porque los enlaces en configuración cis de la Prolina no son reconocidos